- FondsAPO1-APO29, APO30/1-APO30/2, APO31-APO102, APO103/1-APO103/2, APO104-APO2394 - Equipe Archéologie du Proche-Orient hellénistique et romain
- Sous-fondsAPO1697-APO1884 - Archives collectées par le laboratoire
- Série organiqueAPO1697-APO1805 - Archives Ernest Will
- DossierAPO1804 - Correspondance et documentation